Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2785513	2785559	47	5 [0]	[0] 61	ygaR	hypothetical protein

AACGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCT  >  W3110S.gb/2785560‑2785621 |                                                              aaCGTGATGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:802432/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTGACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATc   >  1:733114/1‑61 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGAGAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:328555/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATc   >  1:998593/1‑61 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:565318/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:32446/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:558999/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:475133/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:474570/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:454363/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:453366/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:431205/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:423975/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:421226/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:354027/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:34607/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:324363/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:58060/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:595927/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:645492/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:692279/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:701280/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:713502/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:720298/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:725047/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:778288/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:808721/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:903528/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:905230/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:911185/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:950070/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1406513/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1062692/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1076684/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:109439/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1105539/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1131305/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1167130/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1169231/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1172462/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:118656/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1303403/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1310803/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:131161/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1314128/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1360452/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1042242/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:144005/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1445073/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:1466352/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:173671/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:181602/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:224299/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:246819/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:247772/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:248277/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:248866/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:273309/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:28627/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:292983/1‑62 (MQ=255) aaCGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCt  >  1:31180/1‑62 (MQ=255) |                                                              AACGTGACGTCACCTTCCGGACAGCAAGAAACATTTAAAATATTAATCAATCTAGAACATCT  >  W3110S.gb/2785560‑2785621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑