Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2976483	2976494	12	48 [0]	[0] 25	lysA	diaminopimelate decarboxylase, PLP‑binding

CCCCCTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTC  >  W3110S.gb/2976495‑2976556 |                                                              cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCgacgac        >  1:912366/1‑56 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGt     >  1:175196/1‑59 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:936891/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1001892/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:912569/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:836023/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:832318/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:802570/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:660177/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:659468/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:574295/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:574075/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:53609/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:171598/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1441962/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1422858/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1421408/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1384084/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1293954/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1152329/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1131240/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1043343/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1017660/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTc  >  1:1009411/1‑62 (MQ=255) cccccTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGCCGACGACGGTTTc  >  1:187045/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCCCCTTCCTGCTGGGTAAAGACATCGCCCGATTCACATAACGGTCCGGCGACGACGGTTTC  >  W3110S.gb/2976495‑2976556

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑