Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3019562	3019677	116	4 [0]	[0] 41	ygfM	predicted oxidoreductase

TGCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCA  >  W3110S.gb/3019678‑3019738 |                                                             tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCa           >  1:610706/1‑52 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCTGCCGTTGCa  >  1:912702/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:846947/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:622129/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:649620/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:695891/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:69659/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:742224/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:759451/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:781415/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:808586/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:834819/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:609310/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:871073/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:920074/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:952959/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:955152/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:955448/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:957446/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:971663/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:99799/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1355223/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1114021/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1188902/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1214276/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1219018/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1232231/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1233549/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1238560/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1283823/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1351448/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:100392/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1389396/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:1429597/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:176782/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:219587/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:233787/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:321853/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:405872/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:485717/1‑61 (MQ=255) tgCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCa  >  1:598244/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGCGACCCGCAAAATTAGCCGTTCTCAGGCAGGTTTAACCGTCGTGACGGCAGCCGTTGCA  >  W3110S.gb/3019678‑3019738

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑