Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3037801	3037917	117	8 [0]	[0] 55	xerD	site‑specific tyrosine recombinase

CTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATACAACA  >  W3110S.gb/3037918‑3037978 |                                                             cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGGCCGGTAGCATacaaca  <  1:968843/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:270726/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:179348/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:322355/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:324750/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:330906/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:335129/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:346941/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:46755/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:475312/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:504312/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:514751/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:578778/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:598187/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:62027/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:629409/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:646928/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:664656/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:696029/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:698875/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:723054/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:758396/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:820479/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:821794/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:826905/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:847556/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:849306/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:938114/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1188395/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1030404/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1035302/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1042874/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1083836/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1101415/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1117893/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1119755/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1128173/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1146378/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1151963/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1153865/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1164495/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:118393/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1026683/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1312649/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1322288/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1338412/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1367076/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1370809/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1417079/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:143971/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:143996/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:144684/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:1472650/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:173241/61‑1 (MQ=255) cTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATacaaca  <  1:173966/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTGATATCACTCATTGTCAGTCCGACCAGTTCAGAGACACGCAGCCCGGTAGCATACAACA  >  W3110S.gb/3037918‑3037978

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑