Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3067433 3067673 241 19 [0] [0] 89 [argO]–[mscS] [argO],[mscS]

GGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATCG  >  W3110S.gb/3067672‑3067732
  |                                                          
atcggcATTAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:349033/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCTGATcg  <  1:458197/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:465392/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:628114/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:578583/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:571843/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:570631/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:569983/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:569716/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:568929/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:567026/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:515904/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:497458/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:474826/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:672609/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:431066/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:417826/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:417349/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:414174/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:380953/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:376712/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:350082/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:32169/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:811735/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:995153/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:964057/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:950923/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:933866/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:926941/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:916019/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:868486/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:847908/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:836588/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:836154/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:310642/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:802779/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:786500/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:782710/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:749461/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:738938/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:734420/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:718301/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:696304/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:691237/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:684625/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1196462/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1359573/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1354219/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1317414/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1302665/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1300837/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:128200/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1273171/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1259411/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1209025/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1206632/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:136230/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1183213/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1149081/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1122762/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1116645/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1074504/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1069650/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1066539/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1064922/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1056440/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1054238/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:178403/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:299793/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:283861/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:277722/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:258596/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:25531/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:250495/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:234060/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:100744/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:162580/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:154546/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:151267/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1460676/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1459131/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1441686/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1425063/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1404068/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1387253/59‑1 (MQ=255)
atcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:1379864/59‑1 (MQ=255)
 tcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:208392/59‑1 (MQ=255)
 tcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:217278/59‑1 (MQ=255)
 tcggcATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATcg  <  1:269143/59‑1 (MQ=255)
  |                                                          
GGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATCG  >  W3110S.gb/3067672‑3067732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: