Missing coverage evidence...
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CCTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCG  >  W3110S.gb/3081399‑3081455 |                                                         ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGTCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:366773/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACg         >  1:1240899/1‑50 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:256223/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:925654/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:840180/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:726477/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:58805/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:535851/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:518173/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:481668/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:439606/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:406091/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:355759/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:352765/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:284135/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:119357/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:251796/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:142241/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1390837/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1390302/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1389867/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1343647/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1336703/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1328993/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1309980/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1287653/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:12772/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1194089/1‑57 (MQ=255) ccTTGTGCCCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:1342264/1‑57 (MQ=255) ccTAGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCg  >  1:43948/1‑57 (MQ=255) |                                                         CCTTGTGCGCATTGCCGGATGCGATGCTGGCGCATCTTATCCGGCCTACGGGTGCCG  >  W3110S.gb/3081399‑3081455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑