Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3096132	3096159	28	135 [0]	[0] 52	yggW	predicted oxidoreductase

CTGCTGGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAG  >  W3110S.gb/3096160‑3096220 |                                                             ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGaa   >  1:1131888/1‑60 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGaa   >  1:1311665/1‑60 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGaa   >  1:148381/1‑60 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:737572/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:403557/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:441646/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:447517/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:454668/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:477789/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:528582/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:560169/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:607055/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:620856/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:640726/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:648169/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:661961/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:363038/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:758719/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:776937/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:791374/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:846752/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:867486/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:962765/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:973294/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:975713/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:980229/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:995898/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1010192/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1043899/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1075424/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1174669/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1174880/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1223029/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1287678/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1307128/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1337041/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1371158/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1378223/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1384341/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1432587/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:161957/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:201137/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:21662/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:218978/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:238813/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:253339/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:262293/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:317043/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:384379/1‑61 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTGCGTGCGCATTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGaa   >  1:1022940/1‑60 (MQ=255) ctgctgGACGGCGTACGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:1290803/1‑61 (MQ=255) ctgatgGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAg  >  1:530196/1‑61 (MQ=255) |                                                             CTGCTGGACGGCGTGCGTGCGCGTTTGCCGCTGGCAGCGGATGCAGAAATTACTATGGAAG  >  W3110S.gb/3096160‑3096220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑