Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3117469	3117582	114	6 [0]	[0] 29	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

TGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTG  >  W3110S.gb/3117583‑3117644 |                                                              tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:187266/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:98782/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:966348/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:962042/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:817711/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:79107/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:758857/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:580421/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:538664/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:537847/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:495197/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:307187/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1014851/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1418916/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1397937/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1393047/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1339490/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1282434/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1218401/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1179964/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1158245/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1132601/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1078690/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1076563/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1053429/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGGTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:1345272/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTAGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:676194/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGGGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:207802/62‑1 (MQ=255) tGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTGTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTg  <  1:832533/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTG  >  W3110S.gb/3117583‑3117644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑