Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3156594	3156611	18	80 [0]	[0] 33	yqhG	conserved hypothetical protein

GCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGACC  >  W3110S.gb/3156612‑3156671 |                                                            gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:759707/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:346902/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:374002/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:467744/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:479034/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:504890/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:639828/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:684437/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:727383/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:243831/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:772108/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:82513/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:833954/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:858952/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:859128/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:860597/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:980418/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1000096/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:201654/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:189336/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:150716/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1430679/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1309343/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1281789/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:127784/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1263677/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:125479/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:12243/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1204194/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1173979/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1090790/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1061828/60‑1 (MQ=255) gCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGAcc  <  1:1024131/60‑1 (MQ=255) |                                                            GCCGATCATGCCGATGCCGTTGTGCGCTTTCGTATCTTTAAAGATGATAAAGAAAAGACC  >  W3110S.gb/3156612‑3156671

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑