Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3211652	3211737	86	63 [0]	[0] 33	[rpoD]	[rpoD]

TGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCC  >  W3110S.gb/3211738‑3211797 |                                                            tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTccc  <  1:1040468/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:327510/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:964389/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:429903/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:553917/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:61109/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:622536/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:631723/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:661084/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:675744/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:696922/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:719287/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:814714/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:84446/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:87758/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:940589/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1002641/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:319219/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:155596/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1405039/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1370308/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1362903/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1280677/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1240792/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1232476/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1183003/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1159601/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1120076/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1118533/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1117613/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:10995/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1066092/60‑1 (MQ=255) tGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGcc  <  1:1052567/60‑1 (MQ=255) |                                                            TGTCACCCGTGGTAAGGAGCAAGGCTATCTGACCTATGCCGAGGTCAATGACCATCTGCC  >  W3110S.gb/3211738‑3211797

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑