Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3228843	3229748	906	130 [0]	[0] 61	ygjK	predicted glycosyl hydrolase

TTCCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAC  >  W3110S.gb/3229749‑3229810 |                                                              ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTAc             >  1:1331590/1‑51 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACaa           >  1:133176/1‑53 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACACCCCGCTGAc  >  1:1410750/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:289840/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:604611/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:1352046/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:1292982/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:863772/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGa   >  1:931156/1‑61 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:644132/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:238733/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:416672/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:429076/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:476006/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:520589/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:527315/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:530607/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:561869/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:603104/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:99603/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:961333/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:622132/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:856510/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:686675/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:692310/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:899202/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:887634/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:718846/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:726328/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:754646/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:756782/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:758469/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:759738/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1353710/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1034776/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1065801/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1077324/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1091781/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:109940/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1152755/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1171498/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1206580/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1265980/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1281166/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1303000/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1313123/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1318984/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:351143/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1356401/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1360983/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1371379/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1379987/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1415607/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:162001/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:186138/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:221049/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:224097/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:228849/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:1001744/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAc  >  1:278477/1‑62 (MQ=255) ttcCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCAGCTGAc  >  1:368199/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTCCGGCACGCCAAAGGGTTAACCGCCGATGGACCAATTCAGGAAAATTACAACCCGCTGAC  >  W3110S.gb/3229749‑3229810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑