Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3288186	3288337	152	5 [0]	[0] 50	yraI	predicted periplasmic pilin chaperone

AAAACACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGT  >  W3110S.gb/3288338‑3288398 |                                                             aaaaaaCGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1422585/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACAcc                          >  1:617012/1‑37 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTg                        >  1:108854/1‑39 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGaa                      >  1:21312/1‑41 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGa                  >  1:995869/1‑45 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACTGGTAAACGATGCGt  >  1:980621/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCg   >  1:678450/1‑60 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:648131/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:376400/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:459218/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:463647/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:47212/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:47638/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:994362/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:550380/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:578061/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:968420/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:936481/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:940521/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:65229/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:341786/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:725334/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:759210/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:790784/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:808616/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:84247/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1404384/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1033298/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1087810/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1088541/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1135173/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1224615/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1229905/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1250005/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1306416/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1326599/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1373396/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:357596/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1406703/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1416896/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1441085/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1450749/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1458516/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1458651/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:266416/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:30317/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:311665/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:335465/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:1009665/1‑61 (MQ=255) aaaaCACGGATCAAAACGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGt  >  1:764592/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAAACACGGATCAAAATGTTTTATCGCCCCGCACACCTGAAGGGACGGGTAAACGATGCGT  >  W3110S.gb/3288338‑3288398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑