Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3288900	3289083	184	15 [0]	[0] 67	yraJ	predicted outer membrane protein

TCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTCCC  >  W3110S.gb/3289084‑3289145 |                                                              tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGCTTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:943590/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCGTTccc  <  1:935077/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCGTTccc  <  1:933384/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:483290/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:622383/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:612970/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:609919/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:588843/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:562542/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:557717/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:544079/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:536160/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:634803/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:476310/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:474555/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:386329/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:36260/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:356452/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:630747/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:631220/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:345844/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:649115/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:66616/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:76879/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:786740/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:793263/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:83528/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:840230/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:865303/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:900908/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:948639/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:971591/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:984991/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:342724/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1017372/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1065253/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1090982/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1108327/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1113317/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1134987/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1157233/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:119188/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1203221/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1259205/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1266678/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1285964/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1304259/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1336930/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1361602/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:250175/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1006589/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:315197/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:304335/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:270981/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:269828/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:262415/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1383800/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:206398/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:194863/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:19483/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1717/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:164418/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1441079/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1395587/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATAAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:106686/62‑1 (MQ=255) tCATTCCCGGTACAGCTGCCGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:375589/62‑1 (MQ=255) tCAATCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTccc  <  1:1368073/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCATTCCCGGTACAGCTGCTGAATTTGATTTCAATCATCAGCAACTTAATTTGAGCATTCCC  >  W3110S.gb/3289084‑3289145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑