Missing coverage evidence...
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CTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGC  >  W3110S.gb/3296291‑3296328 |                                      cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:566818/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:372269/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:432784/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:444130/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:452606/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:461016/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:517408/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:519117/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:523473/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:546934/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:547821/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:331354/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:594726/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:601921/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:608159/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:633319/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:648574/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:720303/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:751943/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:774853/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:86500/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:966844/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1371867/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1025448/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1067538/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1083130/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1113482/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1129965/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1262422/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1298323/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1338230/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1344074/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1351134/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1023231/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1393987/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:1409697/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:19143/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:207424/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:226094/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:251070/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:273568/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:285187/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:302835/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGc  <  1:308376/38‑1 (MQ=255) cTTATTTCCGCGCTGCTGTTGC‑AGGTTGTGTTGCCGc  <  1:753323/37‑1 (MQ=37) |                                      CTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGC  >  W3110S.gb/3296291‑3296328

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑