Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3303552	3303557	6	27 [0]	[0] 44	yhbW	hypothetical protein

CACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCTT  >  W3110S.gb/3303558‑3303596 |                                       cACTGACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:9758/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGc    >  1:1304402/1‑37 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:725265/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:485170/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:489477/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:519548/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:535489/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:565263/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:56661/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:611486/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:626703/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:636593/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:677342/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:446102/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:726498/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:749913/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:832859/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:86228/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:889924/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:911398/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:917476/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:993676/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1433708/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1139302/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1143395/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1161678/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1184865/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1239593/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1239888/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1269958/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:128577/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:139213/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1100878/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:1468586/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:158851/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:199058/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:295349/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:320631/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:346348/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:348234/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:355764/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:397528/1‑39 (MQ=255) cACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:418791/1‑39 (MQ=255) cACTCACCATTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCtt  >  1:898121/1‑39 (MQ=255) |                                       CACTCACCGTTGGTCATTGCAGAACAGTTCGGCACGCTT  >  W3110S.gb/3303558‑3303596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑