Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3316564	3317177	614	41 [0]	[0] 42	nusA	transcription termination/antitermination L factor

GACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCT  >  W3110S.gb/3317178‑3317239 |                                                              gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:742048/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:336429/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:346713/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:389265/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:436330/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:458425/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:558903/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:577139/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:595534/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:643353/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:727263/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:302006/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:748585/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:773230/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:834308/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:843786/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:862090/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:906827/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:912264/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:962885/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:963188/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1272847/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1131023/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1132204/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1138994/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:11616/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1184636/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1190696/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1217751/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1222419/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1243710/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1268317/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1009112/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1315021/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1342495/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1365805/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1434210/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:1465179/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:158370/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:195284/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:197452/62‑1 (MQ=255) gACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCt  <  1:275330/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACTTCATCAACAACTAACCAGCGACGGAAAGTGTCAAAATCACCGCTTTTGCGATCGATCT  >  W3110S.gb/3317178‑3317239

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑