Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3356642	3356668	27	11 [0]	[0] 75	gltB	glutamate synthase, large subunit

CCGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATG  >  W3110S.gb/3356669‑3356730 |                                                              ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTATAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1049363/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACaaaa                >  1:427371/1‑48 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCaaa     >  1:36022/1‑59 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCaa      >  1:1205189/1‑58 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:306807/1‑61 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:943770/1‑61 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:384286/1‑61 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:1347660/1‑61 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:1084053/1‑61 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:59459/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:61170/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:590077/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:57447/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:556381/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:552473/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:535088/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:532992/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:527565/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:52708/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:522562/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:522202/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1019359/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:418931/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:406688/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:39332/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:762461/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1019318/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:942379/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:916462/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:852260/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:839495/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:824948/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:816703/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:772064/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:366099/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:726673/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:723349/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:696874/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:691134/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:66390/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:659385/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:613302/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1303242/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:108969/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1101712/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1108360/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1114214/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1128629/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:113895/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1168288/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1188469/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1068205/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1231221/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1240236/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1248641/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1249948/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1258676/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:127563/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1465114/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1026875/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:343798/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:31499/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1013181/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:298305/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:206479/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:160456/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1026732/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:14437/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1397201/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1383318/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1356571/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1041191/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATg  >  1:1336330/1‑62 (MQ=255) ccGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGCCTTGTACAAAATCATGTCCAAAAt   >  1:1166515/1‑61 (MQ=255) ccGTGAAGCTCAACTACCGTAACGGCATAAACAAAGGCTTGTACAAAATAATGTCCAAAATg  >  1:1318126/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGTGATGCTCAACTACCGTAACGGCATCAACAAAGGCTTGTACAAAATCATGTCCAAAATG  >  W3110S.gb/3356669‑3356730

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑