Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3401932	3402002	71	120 [0]	[0] 48	yhdA	conserved inner membrane protein

ACCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATA  >  W3110S.gb/3402003‑3402039 |                                     aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:825286/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:410594/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:46434/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:472206/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:472950/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:542204/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:551327/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:630941/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:666472/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:713801/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:722352/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:774409/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:32413/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:842934/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:843435/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:868048/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:883724/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:894155/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:896966/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:914022/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:929068/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:95940/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:981357/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:990387/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1322232/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:107471/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1085427/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1099009/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:113108/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1146778/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1164431/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:11872/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1209299/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:126945/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1271939/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1315960/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1022931/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1322708/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1326876/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1345382/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1347073/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1348013/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1395064/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:1410682/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:152589/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:22737/37‑1 (MQ=255) aCCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:314495/37‑1 (MQ=255) aCCGCGGCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATa  <  1:172477/37‑1 (MQ=255) |                                     ACCGCGTCCTTTTTCAGGCAACGAGTCATCGTAAATA  >  W3110S.gb/3402003‑3402039

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑