Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3421861	3422040	180	93 [0]	[0] 42	yhdY	predicted amino‑acid transporter subunit

GTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAT  >  W3110S.gb/3422041‑3422102 |                                                              gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATTAt  >  1:328823/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCa   >  1:548131/1‑61 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCa   >  1:358457/1‑61 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:696782/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:526820/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:544569/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:548643/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:549047/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:594145/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:595945/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:63151/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:486207/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:744798/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:747718/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:758764/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:764322/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:772396/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:857105/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:859409/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:878393/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:946842/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:965241/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:260901/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:113618/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1142674/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1157256/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:117890/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1207424/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1244340/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1288516/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:189229/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:524548/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:276582/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:302814/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:316783/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:357874/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:376289/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:419162/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:426637/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:449286/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1091011/1‑62 (MQ=255) gTAATTCCTGGGCTGGAAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAt  >  1:1432807/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAT  >  W3110S.gb/3422041‑3422102

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑