Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3459266	3459539	274	42 [0]	[0] 29	[secE]	[secE]

ATGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCC  >  W3110S.gb/3459540‑3459600 |                                                             aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:441270/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:995630/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:982558/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:877692/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:848081/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:827597/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:802767/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:756456/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:635112/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:603330/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:533504/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:502825/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1085856/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:403285/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:317161/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:204829/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:203104/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:146926/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:144473/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1393118/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1378124/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1363215/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1246274/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:122194/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:1181288/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgccgcc  >  1:116144/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGgc      >  1:646176/1‑57 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTAAGgccgcc  >  1:856360/1‑61 (MQ=255) aTGTTATCGGCAATTAGCTCAGAAATTTTGCTACAACGCCCGCGACAACGTTa          >  1:708657/1‑53 (MQ=25) |                                                             ATGTTATCGGCAATTAGCTCAGAACTTTTGCTACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCC  >  W3110S.gb/3459540‑3459600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑