Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3490383	3491136	754	17 [0]	[0] 40	[pflC]–[pflD]	[pflC],[pflD]

TAACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAT  >  W3110S.gb/3491137‑3491196 |                                                            taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGATAATCGCTGATAAACGAt  >  1:429869/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAAGGAt  >  1:621534/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGa   >  1:826944/1‑59 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:593192/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:557813/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:644076/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:650366/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:667875/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:675270/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:782354/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:786154/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:828698/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:838823/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:848536/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:873233/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:895711/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:896578/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:942247/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:965591/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:980880/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1326606/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1099960/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1137862/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1142235/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1168143/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1251387/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1275088/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1289679/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1019923/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1409933/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1415358/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1447/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:16256/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:18049/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:181257/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:33596/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:374667/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:497764/1‑60 (MQ=255) taACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTACAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:964428/1‑60 (MQ=255) taACGCGAGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAt  >  1:1196371/1‑60 (MQ=255) |                                                            TAACGCGCGCCGCCATCGGTAATATCGCGGCCTTTTTCCAGACAATCGCTGATAAACGAT  >  W3110S.gb/3491137‑3491196

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑