Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3530846	3531011	166	30 [0]	[0] 74	[cpxP]–[cpxR]	[cpxP],[cpxR]

TGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAGCTGC  >  W3110S.gb/3531012‑3531071 |                                                            tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTTACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:895639/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTa               >  1:1238020/1‑47 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:429991/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:579829/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:565140/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:544055/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:497681/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:489708/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:464254/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:447604/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:440479/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:693463/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:427871/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:414020/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:407917/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:402679/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:392197/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:361321/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:345906/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:330889/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:77682/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:925837/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:856697/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:831565/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:827403/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:805354/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:803324/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:784269/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:780202/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:639401/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:771900/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:76600/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:761402/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:755083/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:727725/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:726621/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:726602/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:327977/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1200065/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1003306/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1333713/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1305716/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1304289/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1303802/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1250093/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1233129/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1227708/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1348196/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:117665/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1171035/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1122983/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1106353/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1071859/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1046092/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1044796/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1010844/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:211300/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:303707/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:275620/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:261998/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:235893/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:22758/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:225460/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:199803/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:193742/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:171960/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:165895/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1422110/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1403571/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1374329/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctgc  >  1:1364045/1‑60 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctg   >  1:1358765/1‑59 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctg   >  1:259967/1‑59 (MQ=255) tGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAgctac  >  1:110369/1‑58 (MQ=255) |                                                            TGAATAAAATCCTGTTAGTTGATGATGACCGAGAGCTGACTTCCCTATTAAAGGAGCTGC  >  W3110S.gb/3531012‑3531071

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑