Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3533565	3533772	208	34 [0]	[0] 50	yiiM	conserved hypothetical protein

ATCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCTT  >  W3110S.gb/3533773‑3533829 |                                                         aTCAACCTGGATTTTATCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:675501/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:541783/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:102670/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:295436/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:299585/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:300391/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:368697/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:377797/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:394589/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:417226/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:442257/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:450491/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:463716/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:513529/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:294317/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:580246/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:622840/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:724741/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:776241/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:777204/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:877711/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:882524/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:89891/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:958271/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:970066/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1280022/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1037672/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1042159/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1083748/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1085017/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1112242/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1156309/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1157984/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1201642/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1220540/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:125627/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1268491/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:293964/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1307497/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1369593/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1391580/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1393323/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:191958/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:211749/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:227773/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:250159/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:261098/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:266253/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTCCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:793943/57‑1 (MQ=255) aTCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTCGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCtt  <  1:1334233/57‑1 (MQ=255) |                                                         ATCAACCTGGATTTTAGCAATTGCGCTGGGTTTGCCTTCGGGATAAGCCTGAATCTT  >  W3110S.gb/3533773‑3533829

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑