Missing coverage evidence...
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CATGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTATCTCTC  >  W3110S.gb/3539938‑3539999 |                                                              caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:698248/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:397387/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:402237/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:40756/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:489712/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:521570/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:56997/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:594877/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:65847/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:376761/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:738062/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:779294/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:811295/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:830778/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:888336/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:921629/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:925429/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:948032/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1325103/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1024317/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1114260/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1166883/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:117453/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1218002/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:123202/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1281411/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:128699/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:101524/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:1388071/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:163312/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:197169/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:209726/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:218358/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:269291/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:3104/62‑1 (MQ=255) caTGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTAtctctc  <  1:313340/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATGATACCGCCAGCGCGGTTATCGCCTCGCCGTTAAACGGCTCACGTGCTGCTTATCTCTC  >  W3110S.gb/3539938‑3539999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑