Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3540769	3540786	18	42 [0]	[0] 43	rhaA	L‑rhamnose isomerase

TTGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGAAAA  >  W3110S.gb/3540787‑3540847 |                                                             ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:607496/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1014987/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:273673/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:30187/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:303194/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:338225/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:375213/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:38722/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:448736/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:452974/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:593055/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:270828/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:689989/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:700219/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:794337/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:810839/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:8798/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:933900/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:974072/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:978229/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:997629/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1365022/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1044506/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1052424/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1111605/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1183072/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1192005/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1192037/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1231241/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1311303/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:132218/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:137696/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:14228/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1443967/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1467388/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:17768/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:211212/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:224182/1‑61 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaa   >  1:433412/1‑60 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaa   >  1:1424804/1‑60 (MQ=255) ttGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCAGGTTTTGaaaa  >  1:230363/1‑61 (MQ=255) ttGATAGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:373516/1‑61 (MQ=255) ttGATAGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGaaaa  >  1:1177728/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTGATCGTTTACCCGTTTCAATGCACTGCTGGCAGGGCGATGATGTTTCCGGTTTTGAAAA  >  W3110S.gb/3540787‑3540847

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑