Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3541136	3541373	238	50 [0]	[0] 45	rhaA	L‑rhamnose isomerase

GAGAGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGT  >  W3110S.gb/3541374‑3541414 |                                         gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:703512/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:38913/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:479506/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:512841/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:555582/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:566779/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:56974/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:611359/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:623282/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:638511/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:665562/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:676113/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:367705/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:720928/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:800113/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:840785/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:854175/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:863702/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:867668/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:872881/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:888834/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:97651/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:993883/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:139048/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1060420/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1061342/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:10910/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1101729/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1103382/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1239462/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1301113/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:131675/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1323690/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1356566/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1037261/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1408490/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:144297/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:1467989/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:17040/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:175645/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:192130/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:195050/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:260426/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:305788/41‑1 (MQ=255) gagaGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGt  <  1:310753/41‑1 (MQ=255) |                                         GAGAGCAAATTGTTTGGCATTGGCGCAGAGAGCTACACGGT  >  W3110S.gb/3541374‑3541414

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑