Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3549251	3549262	12	19 [0]	[0] 36	yiiG	conserved hypothetical protein

CACAGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGC  >  W3110S.gb/3549263‑3549324 |                                                              cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:720837/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:437825/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:459290/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:493724/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:498457/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:583902/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:603060/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:644304/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:675765/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:406784/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:724065/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:773928/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:849108/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:876779/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:877597/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:939649/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:991450/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:998878/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:135319/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1165159/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1176131/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1199249/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1205295/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1227390/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1297242/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1319636/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:132299/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1092814/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:141114/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:1466638/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:190291/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:232361/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:287945/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:292272/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:30166/62‑1 (MQ=255) cacaGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGc  <  1:378330/62‑1 (MQ=255) |                                                              CACAGCACTTTTTACGCCTTTTTCACACTCAGCGAGGTTGGATTCACTAATGCCGTAGATGC  >  W3110S.gb/3549263‑3549324

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑