Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3557173	3557636	464	22 [0]	[0] 41	[yiiE]	[yiiE]

GAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAC  >  W3110S.gb/3557637‑3557698 |                                                              gAAAAACGTCATCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCATAGAc  <  1:10847/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:596346/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:338530/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:357718/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:370048/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:390374/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:473982/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:509210/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:524987/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:537081/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:55931/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:584362/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:157576/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:607480/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:640143/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:65276/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:673469/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:83569/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:856311/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:870846/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:944879/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1280346/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1039787/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1045645/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1162268/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1229845/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1255726/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1259289/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1268040/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:127201/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:317736/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1305134/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1331409/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1357299/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1409241/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1411028/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1411387/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:144757/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1466339/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAc  <  1:1002046/62‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCAAAGAc  <  1:1097886/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAAAAACGTCAGCATCCTAACAGCACCAGGATTTAAGGTGAAATTAATCTTTCATCACAGAC  >  W3110S.gb/3557637‑3557698

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑