Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3581558	3581574	17	36 [0]	[0] 65	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTC  >  W3110S.gb/3581575‑3581636 |                                                              cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAgcgc                    >  1:805676/1‑44 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCTAATGCTTCCGGtc  >  1:564780/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCGAATGCTTCCGGtc  >  1:1336471/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCaa             >  1:1387169/1‑51 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:560326/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:599517/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:590172/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:58188/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:578463/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:572070/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:692349/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:530044/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:514208/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:509330/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:490859/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:467252/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:42717/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:42155/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:632842/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:672023/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:393253/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:697514/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:700786/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:705572/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:711193/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:713195/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:814377/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:831764/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:860969/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:916541/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:917682/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:942783/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:947987/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1404107/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1003822/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1025297/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1097365/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:110096/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1138025/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1175765/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1226225/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1262276/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1279985/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1321467/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1389649/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1395407/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:409048/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:283657/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:100294/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:382566/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:379075/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:366138/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:334496/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:292145/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1408188/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:260616/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:243582/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:228349/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:180068/1‑62 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGt   >  1:1275417/1‑61 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGt   >  1:226463/1‑61 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGt   >  1:1073929/1‑61 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGt   >  1:1462827/1‑61 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGt   >  1:627598/1‑61 (MQ=255) cGGGAATGGACGGGCTGGCGCTACTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGtc  >  1:1028980/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTC  >  W3110S.gb/3581575‑3581636

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑