Missing coverage evidence...
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TTGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGTG  >  W3110S.gb/3604247‑3604308 |                                                              ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTTTGCCAGTTGAAGtg  <  1:946682/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTTCCAGTTGAAGtg  <  1:309635/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:991638/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1052724/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:977402/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:974657/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:718559/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:661132/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:644935/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:630646/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:526584/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:40822/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:402346/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:358506/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:291660/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:267345/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:22402/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1404381/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1361409/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1346239/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1328584/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1249954/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1232008/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1111765/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1088306/62‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGtg  <  1:1069595/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTGTCTTCGATACGAATGCCGCCGAACGGTTTCAGTGCTTCAATTTTCTGCCAGTTGAAGTG  >  W3110S.gb/3604247‑3604308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑