Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3632568	3632688	121	28 [0]	[0] 33	rarD	predicted chloramphenical resistance permease

TTAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAT  >  W3110S.gb/3632689‑3632750 |                                                              ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTAt                          >  1:376219/1‑38 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTg    >  1:1098952/1‑60 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGa   >  1:310877/1‑61 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGa   >  1:607638/1‑61 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:55020/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:321319/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:332894/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:33960/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:375129/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:419069/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:450813/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:299969/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:651894/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:722615/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:880514/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:884555/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:989202/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:310443/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1050800/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:264612/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:232904/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:14056/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1327668/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1257096/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1204680/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1204055/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1193000/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:118487/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1157392/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1145695/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1100614/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1091235/1‑62 (MQ=255) ttAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAt  >  1:1069283/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGAT  >  W3110S.gb/3632689‑3632750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑