Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3632962	3632965	4	31 [0]	[0] 52	rarD	predicted chloramphenical resistance permease

TGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAGC  >  W3110S.gb/3632966‑3633026 |                                                             tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgg  >  1:1141716/1‑60 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:652222/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:407601/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:448262/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:463850/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:468826/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:471036/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:516707/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:531602/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:542731/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:552864/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:577552/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:602137/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:615389/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:632940/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:392773/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:667835/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:710602/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:743684/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:748867/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:756214/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:783802/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:828855/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:85784/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:96487/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:971367/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:986157/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1382469/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1026329/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1059244/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1106137/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1121169/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1150486/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:116952/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1193007/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1227974/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1295529/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1306310/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:137835/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1380034/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1015138/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:1428900/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:150454/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:165577/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:18141/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:214685/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:256986/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:26430/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:280190/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:315663/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAgc  >  1:386477/1‑61 (MQ=255) tGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAg   >  1:347990/1‑60 (MQ=255) |                                                             TGGGACTGGCATTTAGTTTTGCCTTCTACGGTCTGGTACGCAAGAAGATTGCCGTTGAAGC  >  W3110S.gb/3632966‑3633026

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑