Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3640628	3640630	3	42 [0]	[0] 21	yigA	conserved hypothetical protein

CAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCG  >  W3110S.gb/3640631‑3640692 |                                                              cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:345671/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:953946/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:814934/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:764706/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:764672/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:633213/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:603082/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:598747/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:548637/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:460735/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:386110/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1062499/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:222349/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:181386/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:175680/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1462718/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1393630/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1381342/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1284433/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:119121/62‑1 (MQ=255) cAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCg  <  1:1158015/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAAACGCTGAATACGCAGCGGTTCGAAAGACTGACGGCTTAATGCCAGATGAGTGTGGTTCG  >  W3110S.gb/3640631‑3640692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑