Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3693302–3693627	3694633	1007–1332	5 [0]	[0] 38	[rrsC]	[rrsC]

CCCATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGT  >  W3110S.gb/3694634‑3694694 |                                                             cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGt                         >  1:25182/1‑38 (MQ=40) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTccccc                    >  1:395966/1‑43 (MQ=38) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCct                   >  1:745175/1‑44 (MQ=38) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTTTTCTTGCGAc    >  1:629444/1‑59 (MQ=11) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:708588/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:410755/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:430980/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:484951/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:48515/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:549929/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:643646/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:395395/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:750499/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:753981/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:772433/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:830891/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:838738/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:908141/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:927766/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:935071/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1371878/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1079502/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1116749/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1170480/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1175984/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1304022/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1310696/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1353830/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1364283/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:1057023/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:216907/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:233521/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:262351/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:306494/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:333511/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGt  >  1:376828/1‑61 (MQ=35) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTATTGCGACGt  >  1:238605/1‑61 (MQ=25) cccATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCACTCTTTTGTc           >  1:36368/1‑52 (MQ=11) |                                                             CCCATCTGGGCACATCTGATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGT  >  W3110S.gb/3694634‑3694694

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑