Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3697196	3697199	4	60 [0]	[0] 56	hsrA	predicted multidrug or homocysteine efflux system

CCATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCG  >  W3110S.gb/3697200‑3697241 |                                          ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:637865/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:369380/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:370513/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:450656/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:45272/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:458141/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:461631/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:48402/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:535051/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:551358/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:614944/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:61900/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:625671/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:627515/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:34149/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:680908/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:71027/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:751675/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:778530/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:800197/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:819026/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:869609/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:878347/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:89831/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:946180/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:958237/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:965308/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:998497/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1412705/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1114207/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1171170/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1206057/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1239331/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1240223/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1253013/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1295773/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1302187/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1329337/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1342811/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1358719/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1378776/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1002612/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1418535/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:146024/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:148990/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:160602/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:172194/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:175770/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:179610/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:193068/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:206922/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:221859/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:233364/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:254325/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:330844/42‑1 (MQ=255) ccATCACACTTGCCGATCT‑ACCGATGACAATGCCAGCAGCg  <  1:1126225/41‑1 (MQ=38) |                                          CCATCACACTTGCCGATCTGACCGATGACAATGCCAGCAGCG  >  W3110S.gb/3697200‑3697241

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑