Missing coverage evidence...
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CAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGC  >  W3110S.gb/3755610‑3755660 |                                                   cAACGCTTCCGAGAGATCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCtt         >  1:1225965/1‑44 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGc                 >  1:282508/1‑36 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCa                >  1:1217918/1‑37 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCACCCCCTTTTTTccc  >  1:355107/1‑49 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAAc              >  1:938693/1‑39 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:88676/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:689081/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:691942/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:731332/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:757736/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:771144/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:779288/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:798307/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:802114/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:847075/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:861989/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:617725/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:942779/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:947260/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:95384/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:957354/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:958880/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:999572/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:370223/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1138454/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1197006/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1213090/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1261520/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:131592/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1376229/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:201356/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:297159/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:364238/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:651430/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:405755/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:431947/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:545192/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:593041/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:593790/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:594171/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:1060390/1‑51 (MQ=255) cAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGc  >  1:635464/1‑51 (MQ=255) |                                                   CAACGCTTCCGAGAGAGCACGGTTATCGAGGTCGGCAACCCCTTTTTTCGC  >  W3110S.gb/3755610‑3755660

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑