Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3755833	3755903	71	7 [0]	[0] 31	rnpA	protein C5 component of RNase P

GGGAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAGCGC  >  W3110S.gb/3755904‑3755966 |                                                               gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCa           >  1:180138/1‑54 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1012986/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:921288/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:839252/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:773346/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:71300/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:694396/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:660057/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:628743/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:553730/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:551995/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:548995/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:368691/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:333098/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:288358/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:194421/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:178415/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:174156/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:154791/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1381244/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1345613/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1314976/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1310575/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1278288/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1181227/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:116950/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:1046643/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgcg   >  1:100091/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgc    >  1:403520/1‑61 (MQ=255) gggAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAG‑AACGGTCAGACGAgcgc  >  1:1057318/1‑62 (MQ=255) gggAAATGCGAGATTAAACACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAgag   >  1:968226/1‑60 (MQ=255) |                                                               GGGAAATGCGAGCTTAACCACTCAGGGGTTAGCTTTATTACTTAGAAACGGTCAGACGAGCGC  >  W3110S.gb/3755904‑3755966

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑