Missing coverage evidence...
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AACTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTGGG  >  W3110S.gb/3793391‑3793452 |                                                              aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTGGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1326429/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:715861/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:45599/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:462097/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:546344/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:550878/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:555145/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:578871/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:587219/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:615952/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:663144/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:663660/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:698715/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1072837/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:798590/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:862014/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:862542/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:926418/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:958584/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:96240/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:972460/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:99081/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:992025/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1401475/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1022783/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:109805/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1099055/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1183138/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1201127/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1243796/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1362235/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1363744/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1421127/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1436119/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:1519/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:171375/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:237318/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:304487/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:380281/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:454932/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTgg   >  1:1381656/1‑61 (MQ=255) aaCTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTgg   >  1:129747/1‑61 (MQ=255) aaCTTTAACATAGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTggg  >  1:454997/1‑62 (MQ=255) aaCTTTAAAATCGCGCAGAACGATATGATTTCGAcc                            >  1:424849/1‑36 (MQ=255) |                                                              AACTTTAACATCGCGCAGAACGATATGATTTCGACCTACGGGTTGAGCATGACGCAGCTGGG  >  W3110S.gb/3793391‑3793452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑