Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3799846	3800158	313	22 [0]	[1] 58	[yicM]–[yicS]	[yicM],[yicS]

GCATAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAC  >  W3110S.gb/3800157‑3800218   |                                                            gCATAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1416838/62‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:725456/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:433619/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:457527/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:529114/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:536604/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:564779/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:58096/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:587244/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:588783/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:597301/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:650178/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:683840/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:710719/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:710905/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:725375/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:418976/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:766489/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:768179/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:773638/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:775323/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:778564/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:836311/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:90259/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:90962/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:919081/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:923347/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:927660/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:957502/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:983147/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:187126/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1054573/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:10823/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1085135/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1130594/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:114897/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1153967/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1202846/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1276067/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1394589/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1410811/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1456883/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:156655/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:174504/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:1046066/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:192317/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:200203/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:200910/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:202938/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:224649/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:23174/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:246682/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:267396/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:31996/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:328815/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:329084/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:353012/60‑1 (MQ=255)   aTAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAc  <  1:385523/60‑1 (MQ=255)   |                                                            GCATAGCGAAAAAAGTGAAAATAAGCAGTAGTGTCGTTGGTTTCATGGATTCAACCTTTTAC  >  W3110S.gb/3800157‑3800218

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑