Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3812668	3812907	240	46 [0]	[0] 31	gltS	glutamate transporter

ATGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAGCGG  >  W3110S.gb/3812908‑3812969 |                                                              aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGTTTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:156687/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTACCCGATGAAgcgg  >  1:1111464/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTACCCGATGAAgcgg  >  1:298166/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGaa      >  1:441033/1‑58 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:893544/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:843409/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:790136/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:780358/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:61469/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:572833/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:495252/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:458810/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1044922/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:452301/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:429047/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:321002/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:949444/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:287928/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:276398/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:260775/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:24462/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:228709/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1429199/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1276209/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1247575/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1243304/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1205072/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1199644/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1161337/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcgg  >  1:1113224/1‑62 (MQ=255) aTGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAgcg   >  1:149927/1‑61 (MQ=255) |                                                              ATGCGCTGGTAATTAAGTTGTATTTGATGTTGCCGATTTTTGCCGGTTAACCGATGAAGCGG  >  W3110S.gb/3812908‑3812969

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑