Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3815936	3816068	133	31 [0]	[0] 31	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

GTGGTGTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAC  >  W3110S.gb/3816069‑3816105 |                                     gtggtgTTAATTGCCGCCGTTAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:628871/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:326636/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:919741/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:89582/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:885412/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:880595/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:746986/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:714645/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:685896/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:597445/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:581061/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:511679/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:467466/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:456034/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:331341/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1003748/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:313545/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:2516/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:221951/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:213389/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:164694/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1453832/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1395833/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1392870/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1341726/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1292296/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1276447/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1235191/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1161232/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAc  >  1:1104740/1‑37 (MQ=255) gtggtgTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTACCAGCGCAc  >  1:725901/1‑37 (MQ=255) |                                     GTGGTGTTAATTGCCGCCGTCAGGTTTGCCAGCGCAC  >  W3110S.gb/3816069‑3816105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑