Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3816308	3816339	32	53 [0]	[0] 13	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

TGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGATT  >  W3110S.gb/3816340‑3816400 |                                                             tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCATAtt  <  1:509763/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:1011983/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:1073238/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:1258669/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:249445/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:453098/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:483175/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:623632/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:685016/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:686707/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:8803/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:964823/61‑1 (MQ=255) tGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTCGCCGGTGCAAGGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGAtt  <  1:612892/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGGGCAGATGTCCGTGGCTTTGGGTTGCCGGTGGAATGGAGGCGTCCCCATGTTGCAGATT  >  W3110S.gb/3816340‑3816400

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑