Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3839740	3839842	103	39 [0]	[0] 38	rfaY	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

GTGATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTA  >  W3110S.gb/3839843‑3839904 |                                                              gtgATATGCCCGATATTTATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGcaatcaaa            >  1:824899/1‑51 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:635669/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:283719/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:103153/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:355149/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:363354/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:393823/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:405140/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:415714/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:512551/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:320123/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:701375/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:714491/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:716441/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:724368/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:876727/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:90690/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:228241/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1092518/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1120304/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1122157/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1134798/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1159932/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1270108/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:129798/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1390787/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1407409/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:1456192/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:147582/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:172147/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:184385/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAAtt           >  1:247329/1‑53 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:441720/1‑62 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:53753/1‑62 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:5621/1‑62 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:1339210/1‑62 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:1416943/1‑62 (MQ=255) gtgATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTa  >  1:856183/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTGATATGCCCGATATTGATGATGCGCTAAAAAATAAAATTCAGCAATCAATTAATGCCTTA  >  W3110S.gb/3839843‑3839904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑