Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3841675	3841696	22	34 [0]	[0] 26	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

AAGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGC  >  W3110S.gb/3841697‑3841757 |                                                             aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATa                         >  1:96590/1‑38 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGt    >  1:486819/1‑59 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTg   >  1:1250869/1‑60 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTg   >  1:1263967/1‑60 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTg   >  1:104413/1‑60 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:164841/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:993827/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:896719/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:813424/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:80116/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:742849/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:687432/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:6839/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:417654/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:21489/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1468313/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1450396/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1318000/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1313800/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1273486/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1240081/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1217231/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1164216/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1124543/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:1098544/1‑61 (MQ=255) aaGATAAAATAAAAGAATTTATTCGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGc  >  1:93261/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAGATAAAATAAAAGAATTTATTGGAGATACAAGAATAGTCATTATTAATCCATTAGGTGC  >  W3110S.gb/3841697‑3841757

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑