Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3844799	3844804	6	42 [0]	[1] 66	rfaF	ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II

CATTGCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCATCAAT  >  W3110S.gb/3844801‑3844861     |                                                         taTTGCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:794505/60‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTTATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1336570/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:548715/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:755925/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:671729/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:663695/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:62096/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:577833/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:569073/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:78252/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:548559/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:544900/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:538694/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:526763/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:478893/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:463507/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:437691/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:407407/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:777768/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:393452/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:794991/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:82982/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:841723/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:850890/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:852300/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:871587/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:894558/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:897934/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:927782/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:938354/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:976662/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:985416/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:986781/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:990450/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1416049/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1008641/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1015727/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:10274/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1027640/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1039481/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1050027/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1100383/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1125512/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1176836/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1304243/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:131574/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1321792/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1356442/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:139798/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1414179/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1006984/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1420975/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:143868/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1440657/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:1440957/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:149643/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:157054/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:180351/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:199328/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:23712/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:273361/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:331869/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:337574/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:356325/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:387201/57‑1 (MQ=255)     gCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAAAAGAACCACCTGATAACCTTCatcaat  <  1:257312/57‑1 (MQ=255)     |                                                         CATTGCCCGCTTCATGATCTTTCGCCGAGCCAAACAGAACCACCTGATAACCTTCATCAAT  >  W3110S.gb/3844801‑3844861

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑