Missing coverage evidence...
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CAGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCGACGAC  >  W3110S.gb/3922209‑3922270 |                                                              caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:774338/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:544524/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:553224/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:558023/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:564373/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:585428/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:590825/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:738723/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:748106/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:332206/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:787114/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:82537/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:872626/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:912539/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:94064/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:956487/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:958870/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:327749/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1125221/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1250484/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1463283/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:157109/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1721/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:227782/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:252127/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:273274/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:299175/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:305733/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:318352/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACAGCgacgac  <  1:1124770/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGGGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1384148/62‑1 (MQ=255) caGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTAATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1205676/62‑1 (MQ=255) caGGAGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1016267/62‑1 (MQ=255) caGGAGGCCAGGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCgacgac  <  1:1014463/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGGCGGCCATGCCATAACGCGTCTCATGGGTGGCAGATCCAATATGCGGTACTGCGACGAC  >  W3110S.gb/3922209‑3922270

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑