Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3948160 3948208 49 4 [0] [2] 42 bcsB regulator of cellulose synthase, cyclic di‑GMP binding

TCTCAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGC  >  W3110S.gb/3948208‑3948269
 |                                                            
tctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACg   <  1:1201222/61‑1 (MQ=255)
tctcAATGATGAACTGATGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1222823/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGTTAAAAAAACGc  <  1:513012/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAActc  <  1:669558/61‑3 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:619919/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:246914/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:274982/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:342341/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:356822/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:370579/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:411014/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:502505/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:56493/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:568432/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:207217/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:703911/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:761369/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:770715/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:784956/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:798698/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:950629/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:982354/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1238945/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1084666/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1090435/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1122200/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1154892/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1181742/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1186607/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1215310/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1234563/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1236120/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:234303/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1274973/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1305854/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1327834/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1345786/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1410420/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1439613/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:150115/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:159211/61‑1 (MQ=255)
 ctcAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGc  <  1:1038443/61‑1 (MQ=255)
 |                                                            
TCTCAATGATGAACTGATGGGCGTGCTGCCAGTGACCAAAGAACAGTTGGGTAAAAAAACGC  >  W3110S.gb/3948208‑3948269

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: