Missing coverage evidence...
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CTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTGG  >  W3110S.gb/3953221‑3953281 |                                                             cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTg                           >  1:1125711/1‑36 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGTGCGTGGCGCTgg  >  1:1352075/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:67245/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:258073/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:270837/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:290637/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:381853/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:448665/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:496580/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:497109/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:523577/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:536336/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:589646/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:601801/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:177778/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:714362/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:720878/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:75724/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:760706/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:812846/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:827214/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:845542/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:875520/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:9598/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:976740/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1233118/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1022166/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1032828/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1042125/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1048058/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:106468/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1084258/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1092098/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1123478/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1143745/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1147435/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:245681/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1255532/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1302020/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1330455/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1346353/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:140373/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1418886/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:142423/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1444353/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTgg  >  1:1019347/1‑61 (MQ=255) cTGGCGAAACTGCCCGCTACAGATAACGCCTCGCTGAacacac                    >  1:1398914/1‑43 (MQ=255) |                                                             CTGGCGAAACTGCCCGCTACCGATAACGCCTCGCTGAACACACAGCGGCGCGTGGCGCTGG  >  W3110S.gb/3953221‑3953281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑