Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3955268	3955368	101	54 [0]	[0] 22	yhjK	predicted diguanylate cyclase

CGCGAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCT  >  W3110S.gb/3955369‑3955430 |                                                              cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:743416/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:905573/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:887322/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:862318/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:832437/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:819409/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:803326/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:801510/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:783709/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:774460/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:753506/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1006135/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:682315/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:526313/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:367628/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:20061/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1421346/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1270188/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1257859/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1215192/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:1131425/62‑1 (MQ=255) cgcgAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCt  <  1:103007/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCGAACTTAACGCCATCCCAGCCAAGGAGCTTGTTGGTCACCAACTGGCATTACCGCGTCT  >  W3110S.gb/3955369‑3955430

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑