Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3956144	3956279	136	65 [0]	[0] 35	yhjK	predicted diguanylate cyclase

CATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATATGGTGG  >  W3110S.gb/3956280‑3956341 |                                                              cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATg                  >  1:871602/1‑46 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:706234/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:418842/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:427778/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:455303/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:465952/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:475238/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:49201/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:616829/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:621679/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:41882/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:731512/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:780022/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:8207/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:829459/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:912685/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:950065/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:982771/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1399640/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1091811/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:123505/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1289600/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1352378/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1366231/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1391216/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1393257/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1011761/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:302050/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:310997/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:317041/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:325570/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:375837/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:397262/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:411402/1‑62 (MQ=255) cATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACAGATGCACCCGAATAtggtgg  >  1:1104120/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATTATGCTGCCCTTGTCGGTAAACCTCTCTGCGCTGCAACTGATGCACCCGAATATGGTGG  >  W3110S.gb/3956280‑3956341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑